Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b4Q8QZY9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3b4Q8QZY9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms