Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms