Protein–RNA interactions for Protein: Q8K572

Hus1b, Checkpoint protein HUS1B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hus1bQ8K572 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hus1bQ8K572 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hus1bQ8K572 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hus1bQ8K572 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms