Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata4Q8K3V1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata4Q8K3V1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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