Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Foxn4Q8K3Q3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms