Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Rdh16f2Q8K3M1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Rdh16f2Q8K3M1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Rdh16f2Q8K3M1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Rdh16f2Q8K3M1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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