Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
OptnQ8K3K8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OptnQ8K3K8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OptnQ8K3K8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms