Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Commd9Q8K2Q0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Commd9Q8K2Q0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd9Q8K2Q0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Commd9Q8K2Q0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Commd9Q8K2Q0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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