Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Depp1Q8K2F3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Depp1Q8K2F3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms