Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmbrd1Q8K0B2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbrd1Q8K0B2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbrd1Q8K0B2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms