Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syne4Q8CII8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syne4Q8CII8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms