Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CopaQ8CIE6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms