Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms