Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU6

Hectd2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd2Q8CDU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hectd2Q8CDU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hectd2Q8CDU6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms