Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc87Q8CDL9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc87Q8CDL9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms