Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa5Q8C7G5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa5Q8C7G5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms