Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7cQ8C6E1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apol7cQ8C6E1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms