Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C5C9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C5C9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C5C9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C5C9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C5C9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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