Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6ka5Q8C050 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms