Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmo3Q8BZL8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmo3Q8BZL8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmo3Q8BZL8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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