Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Iffo1Q8BXL9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Iffo1Q8BXL9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Iffo1Q8BXL9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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