Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt3Q8BXF8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt3Q8BXF8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms