Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp5Q8BX09 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms