Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppm1mQ8BU27 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppm1mQ8BU27 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppm1mQ8BU27 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms