Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zcchc4Q8BKW4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms