Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc2Q8BKV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc2Q8BKV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpc2Q8BKV1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms