Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm2d3Q8BJ83 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm2d3Q8BJ83 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms