Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc155Q80VJ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms