Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Klhl29Q80T74 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms