Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkd1l2Q7TN88 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd1l2Q7TN88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd1l2Q7TN88 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms