Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Topbp1Q6ZQF0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms