Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
March6Q6ZQ89 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
March6Q6ZQ89 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms