Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy1Q6ZQ11 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms