Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC141Q6ZP82 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms