Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV6

Cd200r1l, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r1lQ6XJV6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd200r1lQ6XJV6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd200r1lQ6XJV6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms