Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2eQ6VUP9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2eQ6VUP9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms