Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ift172Q6VH22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ift172Q6VH22 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ift172Q6VH22 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ift172Q6VH22 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms