Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Cd300lfQ6SJQ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300lfQ6SJQ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms