Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SvoplQ6PDF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SvoplQ6PDF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms