Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3bQ6PDC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms