Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab2Q6PAM0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab2Q6PAM0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prkab2Q6PAM0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prkab2Q6PAM0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkab2Q6PAM0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms