Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atl2Q6PA06 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms