Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcd3Q6P9Z1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd3Q6P9Z1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms