Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CltbQ6IRU5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CltbQ6IRU5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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