Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt87Q6IMF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt87Q6IMF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt87Q6IMF0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms