Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt77Q6IFZ6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt77Q6IFZ6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt77Q6IFZ6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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