Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arhgap20Q6IFT4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms