Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msl2Q69ZF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms