Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q66JV7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q66JV7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q66JV7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q66JV7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q66JV7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q66JV7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q66JV7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q66JV7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q66JV7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q66JV7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q66JV7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q66JV7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q66JV7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q66JV7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q66JV7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q66JV7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q66JV7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q66JV7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q66JV7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q66JV7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q66JV7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q66JV7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q66JV7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms