Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf4Q64310 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf4Q64310 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms